参考来自DigitalOcean社区的介绍。
首先请确认搭建好了LEMP环境：在Ubuntu14.04上搭建LEMP环境。

一、安装phpMyAdmin

1.安装phpMyAdmin

安装phpMyAdmin非常简单：
sudo apt-get update
sudo apt-get install phpmyadmin

注意安装时会要求选择web服务器类型，因为Nginx不在其中，所以直接按TAB跳过。

接下然会询问是否使用dbconfig-common来配置phpMyAdmin数据库，这里选择YES。

然后输入MySQL的root密码。

最后创建存储phpMyAdmin自身数据的数据库的密码。

2.创建符号链接

以上安装完毕后还要给phpMyAdmin文件夹创建符号链接，这样才能通过浏览器访问phpMyAdmin：
sudo ln -s /usr/share/phpmyadmin /usr/share/nginx/html

这里符号链接是创建到Nginx web服务器的根路径/usr/share/nginx/html，可以自由修改。

然后使phpMyAdmin的PHP依赖模块mcrypt生效：
sudo php5enmod mcrypt

重启PHP服务：
sudo service php5-fpm restart

这样就可以在浏览器中访问了：
http://server_domain_or_IP/phpmyadmin

登录账号即为root，密码即为MySQL的root密码：

二、加强phpMyAdmin安全设置

1.修改phpMyAdmin登录路径

phpMyAdmin的默认地址为http://server_domain_or_IP/phpmyadmin

为了防止轻易被猜出phpMyAdmin登录界面，可以修改符号链接名字：
cd /usr/share/nginx/html
ls -l

可以看到：
total 8
-rw-r--r-- 1 root root 537 Mar 4 06:46 50x.html
-rw-r--r-- 1 root root 612 Mar 4 06:46 index.html
lrwxrwxrwx 1 root root 21 Aug 6 10:50 phpmyadmin -> /usr/share/phpmyadmin

所以就是要修改最后一行phpmyadmin：
sudo mv phpmyadmin nothingtosee
ls -l

这时：
total 8
-rw-r--r-- 1 root root 537 Mar 4 06:46 50x.html
-rw-r--r-- 1 root root 612 Mar 4 06:46 index.html
lrwxrwxrwx 1 root root 21 Aug 6 10:50 nothingtosee -> /usr/share/phpmyadmin

如果再以http://server_domain_or_IP/phpmyadmin登录就会得到404错误，这时新的登录地址为http://server_domain_or_IP/nothingtosee

2.增加一层登录认证

虽然上述更改了登录phpMyAdmin的登录路径，但仍然有可能被发现登录界面，对登录密码进行暴力破解。

所以可以利用Nginx对phpMyAdmin再增加一层登录口令认证，即输入正确口令后才能进入phpMyAmdin登录界面。

首先创建加密密码：
openssl passwd

输入希望的密码，然后会返回加密后的密码，像这样：
O5az.RSPzd.HE

复制这个密码，下面要用到。

接下来创建登录认证文件：
sudo nano /etc/nginx/pma_pass

在里面输入如下代码：
demo:O5az.RSPzd.HE #demo更改为喜欢的用户名，O5az.RSPzd.HE即为之前复制的加密密码

保存文件并退出。

接下来在Nginx配置文件中对http://server_domain_or_IP/nothingtosee这个路径关联登录认证：
sudo nano /etc/nginx/sites-available/default #这个路径可能需要自行修改

文件内容大体如下：

server {
    . . .

    location / {
        try_files $uri $uri/ =404;
    }

    . . .
}

加入如下代码：

location /nothingtosee {
    auth_basic "Admin Login";
    auth_basic_user_file /etc/nginx/pma_pass;
}

最后如下：

server {
    . . .

    location / {
        try_files $uri $uri/ =404;
    }

    location /nothingtosee {
        auth_basic "Admin Login";
        auth_basic_user_file /etc/nginx/pma_pass;
    }

    . . .
}

保存文件并退出后重启Nginx服务使其生效：
sudo service nginx restart

现在当登录http://server_domain_or_IP/nothingtosee时就会出现：

输入上述创建的用户名和密码后才能进入phpMyAdmin登录界面。